نشان کن
کد آگهی: KP1875224932
شبیه‌سازی دینامیک مولکولی برای کمپلکس لیگاند
در تهران
دورکاری
اطلاعات شغل:
امکان دورکاری و کار در منزل: دارد
نوع همکاری: پروژه‌ای
مهارت‌های مورد نیاز:
شبیه سازی
شبیه ساز سیمولینک
دینامیک
دینامیک سازه
متلب
matlab
نرم افزار matlab
matlab programming
بازه حقوق: از 100,000 تا 1,500,000 تومان
نحوه پرداخت: پروژه‌ای
متن کامل آگهی:
توضیحات پروژه:
هدف این پروژه، شبیه‌سازی دینامیک مولکولی کمپلکس بین یک لیگاند گیاهی و گیرنده جانوری در شرایط فیزیولوژیکی است.
فایل‌های اولیه مورد نیاز (فرمت‌های PDB/MOL2) آماده هستند.
مشخصات فنی پروژه:
تولید توپولوژی لیگاند با استفاده از LigParGen یا acpype
تنظیم سیستم در یک جعبه آب (Water box) به همراه یون‌های خنثی‌کننده در شرایط فیزیولوژیکی
زمان شبیه‌سازی: حداقل 20 نانوثانیه
استفاده از نرم‌افزار GROMACS برای اجرای شبیه‌سازی
خروجی‌های مورد نیاز جهت استفاده در مقاله:
نمودار RMSD در طول زمان
نمودار RMSF (فلکچوئیشن ریشه دوم میانگین مربعات)
نمودار تعداد پیوند هیدروژنی (H-bonds) در طول زمان
نمودار شعاع ژیراسیون (Rg)
فایل‌های خام خروجی شامل log files و trajectory files
یک Snapshot از ساختار نهایی کمپلکس با نمایش واضح لیگاند در محل اتصال
نرم‌افزار مورد استفاده:
GROMACS (به همراه ابزارهای جانبی مانند LigParGen یا acpype برای آماده‌سازی لیگاند)
این آگهی از وبسایت کارلنسر پیدا شده، با زدن دکمه‌ی تماس با کارفرما، به وبسایت کارلنسر برین و از اون‌جا برای این شغل اقدام کنین.
هشدار
گزارش مشکل آگهی
تماس با کارفرما
این آگهی رو برای دیگران بفرست
نشان کن
گزارش مشکل آگهی
جستجوهای مرتبط
یک‌شنبه 6 مرداد 1404، ساعت 19:46