تحلیل Cross-Platform داده‌های GEO و TCGA برای TNBC

آنالیز داده‌های GEO و TCGA برای سه گروه Normal, non-TNBC, TNBC با R/RStudio (پکیج‌ها: limma, GEOquery, clusterProfiler, survival). شامل استخراج DEGs، تحلیل GO/KEGG، ترسیم volcano و heatmap، تحلیل بقا، گزارش PDF/Word (فرمت Q1)، کدهای مستند، جداول و گراف‌ها + ریپوی GitHub و DOI Zenodo. تحویل مرحله‌ای و قابل بازتولید. شرح دقیق پروژه هدف پروژه (Cross-platform comparison بین Normal, non-TNBC, TNBC) خروجی‌های مورد انتظار (DEGs، GO/KEGG، Volcano plot، Heatmap، Survival analysis، گزارش PDF) نرم‌افزار و پکیج‌ها (R, RStudio, limma, GEOquery, clusterProfiler, survival, org.Hs.eg.db) ساختار پوشه‌ها (scripts/, logs/, results/) فرمت تحویل کدهای قابل اجرا + گزارش + جداول + نمودارها توضیح اینکه کد باید بازقابل‌اجرا باشه روی سیستم استاد